Годишната такса за обучение за специалност "Медицина" в МУ-София през учебната 2011-2012 г. ще бъде 900 лв. За студенти, приети преди уч. 2007-2008 г., таксата за обучение ще е 473 лв за година.  Годишната такса за обучение за специалност "Медицинска рехабилитация и ерготерапия" ще е 664 лв за 1 и 2 курс и 700 лв за 3 и 4 курс. Нормативно определената такса за обучение се внася на две равни вноски преди началото на всеки семестър.При незаплащане нормативно определената такса преди започване на семестъра студентите не се записват.


Студентите, прехвърлени от друг Медицински университет в страната, завършили една учебна година, издържали успешно кандидат-студентски изпити, заплащат еднократно среднопретегления норматив за годишната издръжка на един студент по Закона за бюджета за съответната финансова година.

Студентите, прехвърлени от чужбина, които са завършили една учебна година (или един семестър) в съответния Медицински университет, заплащат ежегодно среднопретегления норматив за годишната издръжка на един студент по Закона за бюджета за съответната финансова година.

Дипломираните в специалност Дентална медицина и Фармация, записани за придобиване на ІІ-ра магистърска степен в Медицински факултет заплащат ежегодно среднопретегления норматив за годишната издръжка на един студент по Закона за бюджета за съответната финансова година.